История возникновения первого образовательного учреждения в селе восходит к 1923году. В этом году в частном доме Рамазанова Рамазана были открыты курсы подготовки педагогических кадров для ликбеза местного населения.

Первым преподавателем и организатором этих курсов был Гусейнов Гусен – турецкий эмигрант. На краткосрочных курсах обучались Магомедов Ислам из Табасарана, Маммаев Абдулжалил, Курбанов Исакади и Абдурахманов Магомед из с.Джавгат.

В 1926 году они стали первыми преподавателями ликбеза.

В первой группе ликбеза обучалось 43 человека из молодого поколения. Преподавал Курбанов Исакади. Обучение велось на родном языке, пользовались латинском алфавитом.

Во второй группе ликбеза обучалось 44 человека взрослого населения. Преподавал Абдурахманов Магомед.

В 1929 году была открыта первая начальная школа, в которой было четыре класса. Дети обучались в частных домах.

Ликбез был осуществлён в 1932 году.

В 1935/36 учебном году заведующим начальной школы был Абакаров Мустафа из с.Баршамай.

В 1935 году была создана первая комсомольская организация, состоящая из 5 членов.

Первая комсомолка села – Айдамирова Хадижат.

В 1937 году открылась семилетняя школа. Было построено новое школьное здание. Первым директором семилетней школы был Гарумов Яхья из с.Джинаби. В школе обучалось 220 учащихся. Первые выпускники - Гасанбеков Сулейман и Гусейханов Гусин. В 1937 году была создана пионерская организация. В ней насчитывалось 20 пионеров. Первым пионером был Гусинов Адам.

В 1940/1941учебном году директором школы работал Закарьяев Гаджи из с.Сираги Сергокалинского района.

Через год его забрали в Красную Армию, директором стал Бабаевский, потом Хрунжи, после него – Алибеков.

В 1942 году директором школы стал Магомедов Али из с.Мюрего Сергокалинского района. После него директором работал Абдусаламов Мирзагасан из с. Баршамай.

В 1943 году директором стал Гасанов Магандали Гасанович, учитель родного языка, заслуженный учитель ДАССР, работал до августа 1951 года.

С 1951 по 1954 год директором школы работал Гасанбеков Сулейман Ашуралиевич, отличник народного просвещения РФ.

С 1954 по 1959 год работал директором Мирзаев Габиб С.

С 1959 по 1960 год директором школы работал Гасанбеков Сулейман Ашуралиевич.

С 1960 по 1962 год директором школы работал Шерипов Иманзагир Абдулжалилович.

С 1 июня 1962 года школа стала восьмилетней, а с сентября 1967 года – средней.

С 1962 по 1966 год директором школы работал Мирзаев Салам Мирзаевич, заслуженный учитель ДАССР.

В 1966 году были оборудованы в школе кабинеты физики, химии, русского языка, географии, истории.

С 1966 по 1968 год директором школы работал Гасанов Магандали Гасанович.

С 1968 по 1978 год директором школы работал Мирзаев Салам Мирзаевич , заслуженный учитель ДАССР.

С 1978 по 1984 год работал директором школы Султанбеков Мердем А, .

С 1984 по 1986 год работал директором школы Гасанов Гаджибек Магандалиевич.

С 1986 по 1994 год директором школы работал Мирзаев Гапиз Мирзаевич, отличник народного просвещения РФ.

С 1994 по 2010 год работал директором школы Гасанов Гаджибек Магандалиевич, заслуженный учитель ДАССР.

В 2010-2011 учебном году директором школы работал Мирзаев Магомед Мирзаевич, отличник народного просвещения РСФСР, ведущий физик в районе, чей опыт распространяется по школам нашей республики

С 2011 года директором школы работает Гусейханова Аймисей Магомедовна, Почётный работник общего образования РФ.

В 2017-2018 учебном году в школе обучается 400 учеников. В педагогическом коллективе МКОУ "Джавгатская СОШ" работают 57 учителей, 50 учителей имеют высшее образование.